ISO 22949-1:2021
(Main)Molecular biomarker analysis — Methods of analysis for the detection and identification of animal species in food and feed products (nucleotide sequencing-based methods) — Part 1: General requirements
Molecular biomarker analysis — Methods of analysis for the detection and identification of animal species in food and feed products (nucleotide sequencing-based methods) — Part 1: General requirements
This document specifies general requirements for DNA sequencing method performance in the detection and identification of animal species in food and feed products. Performance requirements are limited to Sanger and next generation sequencing (NGS), including second and third generation sequencing, for analysis of single species products and multispecies products. This document is applicable to DNA sequences for mammals, birds, fish, molluscs, crustaceans, amphibians, reptiles and insects, and to the validation of the applicable methods. Methods for DNA species quantification are not considered under the scope of this document.
Analyse moléculaire de biomarqueurs — Méthodes d’analyse pour la détection et l’identification d’espèces animales dans les aliments et les aliments pour animaux (méthodes basées sur le séquençage des nucléotides) — Partie 1: Exigences générales
Le présent document spécifie les exigences générales relatives à la performance de la méthode de séquençage de l’ADN pour la détection et l’identification d’espèces animales dans les aliments et les produits alimentaires. Les exigences de performance se limitent au séquençage Sanger et au séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris les séquençages de deuxième et troisième générations, pour l’analyse de produits mono-espèces et de produits multi-espèces. Le présent document est applicable aux séquences d’ADN de mammifères, oiseaux, poissons, mollusques, crustacés, amphibiens, reptiles et insectes, ainsi qu’à la validation des méthodes correspondantes. Les méthodes de quantification de l’espèce d’ADN ne font pas partie du domaine d’application du présent document.
General Information
Standards Content (Sample)
INTERNATIONAL ISO
STANDARD 22949-1
First edition
2021-10
Molecular biomarker analysis —
Methods of analysis for the detection
and identification of animal species
in food and feed products (nucleotide
sequencing-based methods) —
Part 1:
General requirements
Analyse moléculaire de biomarqueurs — Méthodes d’analyse pour la
détection et l’identification d’espèces animales dans les aliments et
les aliments pour animaux (méthodes basées sur le séquençage des
nucléotides) —
Partie 1: Exigences générales
Reference number
© ISO 2021
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Website: www.iso.org
Published in Switzerland
ii
Contents Page
Foreword .v
Introduction . vi
1 Scope . 1
2 Normative references . 1
3 Terms and definitions . 1
4 Performance characteristics of the methods . 1
4.1 General . 1
4.2 Fitness for purpose of the method . 2
4.3 Scientific basis . 2
4.3.1 General . 2
4.3.2 Sanger sequencing . 2
4.3.3 Next generation sequencing . 2
4.4 Units of measurement . 3
4.5 Applicability . 3
4.5.1 Meat or food product considerations . 3
4.5.2 Sampling plan . 3
4.5.3 Genomic considerations . 3
4.5.4 Method testing . 3
4.6 Primer selection and evaluation . 4
4.7 Database construction and evaluation . 4
4.8 Selectivity and nucleotide sequence specificity . 5
4.8.1 General . 5
4.8.2 Requirements for inclusivity testing . 5
4.8.3 Evaluation of non-targeted DNA interference . 5
4.9 Sensitivity . 6
4.9.1 General . 6
4.9.2 Limit of detection . 6
4.10 Robustness . 6
4.10.1 General . 6
4.10.2 Robustness determination by inter-laboratory study . 6
4.10.3 Robustness determination by a multifactorial orthogonal test design . 7
5 Single-laboratory validation . 7
6 Interlaboratory study (collaborative study) . 7
7 General laboratory and procedural requirements . 7
7.1 General . 7
7.2 Facilities, materials and equipment . 8
7.3 Sample preparation . 8
7.3.1 General . 8
7.3.2 Category A: single species sample consisting of a single piece . 8
7.3.3 Category B: single species product composed by several pieces or units of
the same type of tissue . 9
7.3.4 Category C: multiple mixed species processed product including those of
non-meat origin or different types of tissues as ingredients . 9
7.4 DNA extraction . 9
7.5 DNA sequencing workflow. 10
7.5.1 General . 10
7.5.2 Sanger sequencing method . 10
7.5.3 Next generation sequencing method . 11
7.6 DNA sequence data analysis and interpretation . 14
7.7 Expression of results . . 14
8 Validation of the NGS bioinformatics pipeline .14
iii
8.1 General . 14
8.2 Quality metrics . 14
9 Test report .15
Annex A (informative) General workflow of the laboratory analytical procedure .16
Annex B (informative) Comparison between Sanger sequencing and next generation
sequencing .17
Annex C (informative) In silico workflow for primer set selection .18
Bibliography .20
iv
Foreword
ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards
bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out
through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical
committee has been established has the right to be represented on that committee. International
organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work.
ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of
electrotechnical standardization.
The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are
described in the ISO/IEC Directives, Part 1. In particular, the different approval criteria needed for the
different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the
editorial rules of the ISO/IEC Directives, Part 2 (see www.iso.org/directives).
Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of
patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of
any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or
on the ISO list of patent declarations received (see www.iso.org/patents).
Any trade name used in this document is information given for the convenience of users and does not
constitute an endorsement.
For an explanation of the voluntary nature of standards, the meaning of ISO specific terms and
expressions related to conformity assessment, as well as information about ISO’s adherence to
the World Trade Organization (WTO) principles in the Technical Barriers to Trade (TBT), see
www.iso.org/iso/foreword.html.
This document was prepared by Technical Committee ISO/TC 34, Food products, Subcommittee SC 16,
Horizontal methods for molecular biomarker analysis.
A list of all parts in the ISO 22949 series can be found on the ISO website.
Any feedback or questions on this document should be directed to the user’s national standards body. A
complete listing of these bodies can be found at www.iso.org/members.html.
v
Introduction
This document provides general guidance for deoxyribonucleic acid (DNA) sequencing for animal
species detection or identification, or both, in food and feed products. DNA sequencing is the process of
determining the order of the four nucleotide bases (adenine, guanine, cytosine and thymine) in a nucleic
acid polymer. Nucleic acid polymers can
...
NORME ISO
INTERNATIONALE 22949-1
Première édition
2021-10
Analyse moléculaire de
biomarqueurs — Méthodes d’analyse
pour la détection et l’identification
d’espèces animales dans les aliments
et les aliments pour animaux
(méthodes basées sur le séquençage
des nucléotides) —
Partie 1:
Exigences générales
Molecular biomarker analysis — Methods of analysis for the detection
and identification of animal species in food and feed products
(nucleotide sequencing-based methods) —
Part 1: General requirements
Numéro de référence
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Tél.: +41 22 749 01 11
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Web: www.iso.org
Publié en Suisse
ii
Sommaire Page
Avant-propos .v
Introduction . vi
1 Domaine d’application . 1
2 Références normatives .1
3 Termes et définitions . 1
4 Caractéristiques de performance des méthodes . 2
4.1 Généralités . 2
4.2 Adéquation à un but de la méthode . 2
4.3 Base scientifique . 2
4.3.1 Généralités . 2
4.3.2 Séquençage Sanger . 2
4.3.3 Séquençage de nouvelle génération. 3
4.4 Unités de mesure . 3
4.5 Applicabilité . 3
4.5.1 Considérations relatives au produit carné ou au produit alimentaire . 3
4.5.2 Plan d’échantillonnage . 3
4.5.3 Considérations génomiques . 4
4.5.4 Évaluation de la méthode . 4
4.6 Sélection et évaluation des amorces . 4
4.7 Construction et évaluation de la base de données . 4
4.8 Sélectivité et spécificité de la séquence nucléotidique . 5
4.8.1 Généralités . 5
4.8.2 Exigences relatives aux essais d’inclusivité . 5
4.8.3 Évaluation des interférences de l’ADN non-cible . 6
4.9 Sensibilité . 6
4.9.1 Généralités . 6
4.9.2 Limite de détection . 6
4.10 Robustesse . 7
4.10.1 Généralités . 7
4.10.2 Détermination de la robustesse par une étude interlaboratoires. 7
4.10.3 Détermination de la robustesse par un essai orthogonal multifactoriel . 7
5 Validation intralaboratoire .7
6 Étude comparative interlaboratoires . 7
7 Exigences générales du laboratoire et du mode opératoire . 8
7.1 Généralités . 8
7.2 Installations, matériaux et équipement . 8
7.3 Préparation de l’échantillon . 9
7.3.1 Généralités . 9
7.3.2 Catégorie A: échantillon mono-espèce constitué d’un seul morceau . 9
7.3.3 Catégorie B: produit mono-espèce constitué de plusieurs morceaux ou
unités du même type de tissu . 9
7.3.4 Catégorie C: produit traité contenant plusieurs espèces mélangées,
notamment produit d’origine non carnée, ou différents types de tissus
comme ingrédients . . 10
7.4 Extraction de l’ADN . 10
7.5 Processus de séquençage de l’ADN . 10
7.5.1 Généralités . 10
7.5.2 Méthode de séquençage Sanger . 11
7.5.3 Méthode de séquence de nouvelle génération .12
7.6 Analyse et interprétation des données de séquences d’ADN . 15
7.7 Expression des résultats . 15
iii
8 Validation du pipeline bio-informatique du NGS .15
8.1 Généralités . 15
8.2 Mesures de qualité . 15
9 Rapport d’essai .16
Annexe A (informative) Logigramme général du mode opératoire analytique du laboratoire .17
Annexe B (informative) Comparaison entre le séquençage Sanger et le séquençagede
nouvelle génération .18
Annexe C (informative) Processus in silico pour la sélection d’une combinaison d’amorces .19
Bibliographie .20
iv
Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude
a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui
concerne la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier, de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été
rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2 (voir
www.iso.org/directives).
L’attention est attirée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant
les références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de
l’élaboration du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou dans la liste des déclarations de
brevets reçues par l’ISO (voir www.iso.org/brevets).
Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données
pour information, par souci de commodité, à l’intention des utilisateurs et ne sauraient constituer un
engagement.
Pour une explication de la nature volontaire des normes, la signification des termes et expressions
spécifiques de l’ISO liés à l’évaluation de la conformité, ou pour toute information au sujet de l’adhésion
de l’ISO aux principes de l’Organisation mondiale du commerce (OMC) concernant les obstacles
techniques au commerce (OTC), voir www.iso.org/avant-propos.
Le présent document a été élaboré par le comité technique ISO/TC 34, Produits alimentaires, sous-
comité SC 16, Méthodes horizontales pour l’analyse moléculaire de biomarqueurs.
Une liste de toutes les parties de la série ISO 22949 se trouve sur le site web de l’ISO.
Il convient que l’utilisateur adresse tout retour d’information ou toute question concernant le présent
document à l’organisme national de normalisation de son pays. Une liste exhaustive desdits organismes
se trouve à l’adresse www.iso.org/fr/members.html.
v
Introduction
Le présent document fournit des recommandations générales relatives au séquençage de l’acide
désoxyribonucléique (ADN) pour la détection ou l’id
...
Questions, Comments and Discussion
Ask us and Technical Secretary will try to provide an answer. You can facilitate discussion about the standard in here.